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蝴蝶兰液泡型ATP酶E亚基基因的克隆及序列分析
作者: 袁秀云 [1] 田云芳 [2] 梁芳 [1] 蒋素华 [1] 许申平 [1] 王默霏 [1] 崔波 [1]
关键词: 蝴蝶兰 液泡型ATP酶 E亚基 RACE 序列分析
摘要:E亚基是液泡型ATP酶(V-ATPase)多亚基复合体的重要组成部分,响应植物的非生物胁迫,对其基因的克隆及分析有助于阐释其逆境条件下的分子调节机制.根据蝴蝶兰低温诱导差异蛋白的序列设计简并引物,利用RT-PCR和RACE技术从蝴蝶兰叶片中克隆获得2条V-ATPaseE亚基的cDNA序列,分别命名为Ph VHA-Ea和Ph VHA-Eb,GenBank登录号分别为KT758849和KT758850.PhVHA-Ea和PhVHA-Eb全长分别为960 bp和1 036 bp,二者均具有687 bp的开放阅读框,编码228个氨基酸,包含相同的vATP-synt_E保守域;生物信息学分析表明,2个序列编码蛋白具有相似的二级结构和相同的亲水性,预测的三级结构也相同.系统进化树分析显示,蝴蝶兰PhVHA-Ea和PhVHA-Eb与单子叶植物液泡型ATP酶E亚基距离最近.
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