郑州地区2种菊花病毒CP基因的克隆与序列分析

作者: 梁芳 [1] 刘瑞霞 [2] 张燕 [1] 王默霏 [1] 崔波 [1] 李静 [3]

关键词: 菊花番茄不孕病毒菊花B病毒外壳蛋白基因序列分析

摘要：为了探明郑州地区感病菊花上病毒的种类及来源,采集有明显病症的菊花样品,根据已知的番茄不孕病毒(TAV)和菊花B病毒(CVB)的基因序列设计特异性引物,采用RT-PCR扩增其外壳蛋白(CP)基因的方法对这2种病毒进行了检测,然后进行序列同源性及系统进化分析.结果显示,所得TAV的CP基因序列长度为481 bp,NCBI登录号为KU873003;所得3条CVB的CP基因序列长度均为547 bp,NCBI登录号分别为KU873004、KU873005、KU873006.将郑州分离物的CP基因与NCBI上已登录的其他分离物进行比对,TAV核苷酸序列同源性为91% ~99%,氨基酸序列同源性为86% ~100%;CVB核苷酸序列同源性为76% ~99%,氨基酸序列同源性为77% ~99%.系统进化分析表明,菊花TAV郑州分离物与北京分离物KP019201、黑龙江分离物KP019202、河南分离物 KP019200和山西分离物 KP019204的亲缘关系最近;CVB 郑州分离物与印度分离物AJ812569、AJ871367的亲缘关系最近.

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郑州地区2种菊花病毒CP基因的克隆与序列分析

作者: 梁芳 [1] 刘瑞霞 [2] 张燕 [1] 王默霏 [1] 崔波 [1] 李静 [3]

关键词: 菊花 番茄不孕病毒 菊花B病毒 外壳蛋白基因 序列分析

关键词: 菊花番茄不孕病毒菊花B病毒外壳蛋白基因序列分析