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小麦CBL4基因密码子使用特征分析
作者: 陈文烨 [1] 焦义然 [1] 杨军峰 [2] 刘永伟 [3] 杨帆 [3] 董福双 [3] 王海波 [3] 杜进民
关键词: 小麦 CBL4 相对同义密码子使用度 密码子偏好性
摘要:采用CodonW和Usage Codon软件分析小麦CBL4基因密码子偏好性,并将其与其他17种不同目植物CBL4基因密码子偏好性进行比较,利用最小进化法分析多种植物的亲缘关系,以期为小麦CBL4基因改良以提高对干旱、低温和盐胁迫等逆境的抗性提供理论依据.结果表明,GC含量对小麦CBL4基因密码子偏好性具有重要的影响,小麦的G+C所占比例达58.0%,其中以第3位GC含量为主,而马铃薯对密码子的使用特征与小麦差异最大,形成鲜明的对比.小麦偏好使用CUC、AGG、UAA、AUC、GUG、GCG、ACG、UGC和GGC密码子,小麦等植物密码子偏好性结果与系统发育分析得出的亲缘关系结果一致.
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