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溶藻弧菌TolB蛋白的生物信息学分析
作者: 伍娜娜 康超 荣娜 刘祥 陈春琳 陈琛 丁锐 吴三桥
关键词: 溶藻弧菌 TolB蛋白 表位疫苗 抗原分析 生物信息学分析
摘要：对溶藻弧菌转运蛋白(TolB)进行结构和功能进行分析,设计其表位多肽重组疫苗,以提高溶藻弧菌TolB蛋白的免疫效果,运用生物信息学方法对溶藻弧菌TolB蛋白的系统进化关系、理化性质、高级结构和细胞抗原表位进行分析.进化关系结果显示,溶藻弧菌的TolB蛋白与副溶血性弧菌、霍乱弧菌和费氏弧菌的TolB蛋白具有较高同源性,溶藻弧菌TolB蛋白可能对这4种菌株的感染起到交叉免疫保护作用.溶藻弧菌TolB蛋白为亲水性蛋白,1-22位氨基酸为其信号肽位置,无跨膜结构并定位于细胞膜外;溶藻弧菌TolB蛋白二级结构中以无规则卷曲(40.00％)、α-螺旋(18.67％)和β-转角(1 1.33％)为主.溶藻弧菌TolB蛋白可能存在4个优势B细胞抗原表位,1个细胞毒性T淋巴细胞(CTL)抗原表位,1个辅助T细胞(Th)抗原表位,并重组拼接获得抗原性较好的TolB蛋白表位多肽.
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