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玉米ZmHDR基因的分子克隆及生物信息学分析
作者: 鲁晓民 ; 王振华 ; 张新 ; 张前进 ; 魏昕
关键词: 玉米 ZmHDR基因 RT-PCR 生物信息学分析
摘要:为了解ZmHDR在玉米叶绿体发育过程中的作用机制及进化模式,利用RT-PCR方法克隆了玉米HDR基因,并对其进行了生物信息学分析。结果表明,ZmHDR基因在玉米基因组中以单拷贝形式存在,全长序列为3 188bp,其中含有1 389bp的开放阅读框,编码1个由462个氨基酸组成的蛋白;半定量PCR分析表明,该基因是一个组成型表达的基因;不同物种氨基酸序列比对结果显示,ZmHDR基因与高粱、水稻、黄花蒿、烟草、三叶胶、孜然芹、拟南芥、青色藻同源性比较高,暗示该基因在进化上具有高度的保守性。