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小麦F—box蛋白基因的电子克隆和生物信息学分析
作者: 王俊生 ; 李俐俐 ; 杨欢 ; 谭光轩 ; 殷贵鸿
关键词: 小麦 F—box蛋白基因 电子克隆 生物信息学
摘要:为探讨F—box蛋白在小麦发育过程中的调节作用,利用电子克隆技术获得了一个小麦F—box蛋白基因,采用生物信息学方法,对其编码的蛋白质从序列特征、理化性质、跨膜结构域、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,小麦F—box蛋白由362个氨基酸组成,在N端和C端分别存在一个F—box保守结构域和一个DUF295保守结构域(功能未知),该蛋白质二级结构中以a-螺旋(23.48%)、扩展束(25.41%)和无规则卷曲(47.24%)为主,在94-1150-点处可能存在一个由内向外的跨膜区,N端不存在信号肽序列,亚细胞定位于细胞质中;该F—box蛋白与二穗短柄草、玉米和水稻的F—box蛋白相似性较高,进化距离较近。
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