- · 我院召开“十四五”科技创新规划座谈会[01/07]
- · 我院召开“十四五”规划推进会[01/02]
- · 河南日报报业集团副总编辑孙德中一行来我院调研[01/01]
- · 广东省农业科学院院长陆华忠一行到我院考察调研[12/31]
- · 国家重点研发计划“猪重要疫病的诊断与检测新技术研究”项目推进会在郑州召开[12/30]
- · 我院召开种子工作座谈会[12/25]
- · 中共河南省农业科学院直属单位第三次代表大会胜利召开[12/24]
- · 省农业农村厅厅长申延平一行到我院调研[12/23]
拟南芥核苷二磷酸激酶基因家族的生物信息学比较与分析
作者: 孙小洁 ; 王增兰
关键词: 拟南芥 生物信息学 核苷二磷酸激酶家族 序列分析 系统分析
摘要：为研究拟南芥核苷二磷酸激酶家族（AtNDPKs）5个成员之间的差异,对其在蛋白质结构、磷酸化位点、信号肽序列、功能区方面的差异进行了生物信息学的比较分析,并建立了系统进化树。结果显示,5个成员在等电点、吸光值和亲水性方面的差异明显。二级结构中,AtNDPK2的α螺旋比例与其他成员差异显著;在β转角和无规则卷曲方面,AtNDPK1a与AtNDPK3a表现出相反的情况。5个成员各含有1个NDK结构域,但分布位置不同。AtNDPK3a中酪氨酸磷酸化明显增多,AtNDPK1a的磷酸化位点与其他成员差异显著。AtNDPK1和AtNDPK2的信号肽裂解点位于第16和17位氨基酸之间,AtNDPK3和AtNDPK3a的位于第42和43位之间,而AtNDPK1a的位于第24和25位之间。AtNDPK1a的进化地位高于其他成员,AtNDPK3与AtNDPK3a的亲缘关系最近,而AtNDPK1与其他成员的亲缘关系较远。