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郑麦366α-醇溶蛋白基因的克隆及生物信息学分析
作者: 李文旭 常阳 杨攀 王美芳 何盛莲 吴政卿 雷振生 晁岳恩
关键词: 小麦 α-醇溶蛋白 克隆 生物信息学
摘要:为研究优质强筋小麦品种郑麦366α-醇溶蛋白的组成,应用简并引物进行PCR扩增,从郑麦366中扩增得到13条核苷酸序列,其中9条序列推导的氨基酸序列具有完整的开放阅读框.进一步分析显示,克隆的9个基因(分别命名为ZM366-1-ZM366-9)编码的蛋白质均具有α-醇溶蛋白的典型结构特征,根据T-细胞毒性抗原表位数目和多聚谷氨酰胺区特征分别将ZM366-1、ZM366-2定位到6A染色体,ZM366-3、ZM366-4定位到6D染色体,ZM366-5-ZM366-9定位到6B染色体.蛋白质二级结构预测显示,克隆的9个α-醇溶蛋白都仅含有α-螺旋结构,其中B基因组α-醇溶蛋白的α-螺旋含量明显高于其他基因组.同源系统进化树分析表明,克隆的9个α-醇溶蛋白具有明显的基因组特异性.
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